MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome

Total Repeats: 54735

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_015183	CCA	2	6	85718	85723	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325291527
1502	NC_015183	CAA	2	6	85748	85753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325291527
1503	NC_015183	CATC	2	8	85772	85779	25 %	25 %	0 %	50 %	325291527
1504	NC_015183	TCA	2	6	85780	85785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291527
1505	NC_015183	CG	4	8	85826	85833	0 %	0 %	50 %	50 %	325291527
1506	NC_015183	CCG	2	6	85834	85839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291527
1507	NC_015183	GCGG	2	8	85982	85989	0 %	0 %	75 %	25 %	325291527
1508	NC_015183	GACG	2	8	86032	86039	25 %	0 %	50 %	25 %	325291527
1509	NC_015183	GCC	2	6	86058	86063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291527
1510	NC_015183	GAA	2	6	86115	86120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325291527
1511	NC_015183	ACC	2	6	86152	86157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325291527
1512	NC_015183	GCGG	2	8	86240	86247	0 %	0 %	75 %	25 %	325291527
1513	NC_015183	GCG	2	6	86559	86564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291528
1514	NC_015183	CTT	3	9	86607	86615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325291528
1515	NC_015183	CGG	2	6	86635	86640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291528
1516	NC_015183	ACG	2	6	86664	86669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291528
1517	NC_015183	CTT	2	6	86682	86687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325291528
1518	NC_015183	GTT	2	6	86712	86717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325291528
1519	NC_015183	TTCG	2	8	86769	86776	0 %	50 %	25 %	25 %	325291528
1520	NC_015183	TGA	2	6	86789	86794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291528
1521	NC_015183	GGC	2	6	86796	86801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291528
1522	NC_015183	TC	3	6	87030	87035	0 %	50 %	0 %	50 %	325291529
1523	NC_015183	GCA	2	6	87105	87110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291529
1524	NC_015183	ATC	2	6	87145	87150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291529
1525	NC_015183	TGA	3	9	87153	87161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291529
1526	NC_015183	CCG	2	6	87186	87191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291529
1527	NC_015183	TCG	2	6	87227	87232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291529
1528	NC_015183	CAT	2	6	87277	87282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291529
1529	NC_015183	CG	3	6	87360	87365	0 %	0 %	50 %	50 %	325291529
1530	NC_015183	AGC	2	6	87437	87442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291529
1531	NC_015183	CG	4	8	87465	87472	0 %	0 %	50 %	50 %	325291529
1532	NC_015183	GCG	3	9	87546	87554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291529
1533	NC_015183	GGA	2	6	87622	87627	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325291529
1534	NC_015183	TCG	2	6	87650	87655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291529
1535	NC_015183	TTC	2	6	87664	87669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325291529
1536	NC_015183	TGG	2	6	87729	87734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325291529
1537	NC_015183	AGCC	2	8	87875	87882	25 %	0 %	25 %	50 %	325291529
1538	NC_015183	GGC	2	6	87891	87896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291529
1539	NC_015183	CTG	2	6	87913	87918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291529
1540	NC_015183	TCG	2	6	87950	87955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291530
1541	NC_015183	TTCG	2	8	87961	87968	0 %	50 %	25 %	25 %	325291530
1542	NC_015183	TCT	2	6	88017	88022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325291530
1543	NC_015183	TCG	2	6	88043	88048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291530
1544	NC_015183	GGC	2	6	88098	88103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291530
1545	NC_015183	TGA	2	6	88137	88142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291530
1546	NC_015183	GCG	2	6	88167	88172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291530
1547	NC_015183	TCG	2	6	88250	88255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291530
1548	NC_015183	CGC	2	6	88263	88268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291530
1549	NC_015183	GCG	2	6	88289	88294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291530
1550	NC_015183	GCA	2	6	88314	88319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291530
1551	NC_015183	GAT	2	6	88337	88342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291530
1552	NC_015183	ACG	2	6	88595	88600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291531
1553	NC_015183	CAC	2	6	88626	88631	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325291531
1554	NC_015183	ACG	2	6	88649	88654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291531
1555	NC_015183	ACG	2	6	88729	88734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291531
1556	NC_015183	CGC	2	6	88759	88764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291531
1557	NC_015183	CCA	2	6	88776	88781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325291531
1558	NC_015183	GAT	2	6	88789	88794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291531
1559	NC_015183	GTA	2	6	88798	88803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291531
1560	NC_015183	GAT	2	6	88870	88875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291531
1561	NC_015183	GCACCA	2	12	88922	88933	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	325291531
1562	NC_015183	AGCGA	2	10	88979	88988	40 %	0 %	40 %	20 %	325291531
1563	NC_015183	TGA	2	6	89022	89027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291531
1564	NC_015183	TCA	2	6	89067	89072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291531
1565	NC_015183	GC	4	8	89283	89290	0 %	0 %	50 %	50 %	325291531
1566	NC_015183	CAA	2	6	89313	89318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325291531
1567	NC_015183	CAC	2	6	89370	89375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325291531
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1569	NC_015183	CAC	2	6	89529	89534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325291531
1570	NC_015183	TGC	2	6	89558	89563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291531
1571	NC_015183	AGC	2	6	89564	89569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291531
1572	NC_015183	TTG	2	6	89612	89617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325291531
1573	NC_015183	ACG	2	6	89624	89629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291531
1574	NC_015183	GCC	2	6	89642	89647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291531
1575	NC_015183	TTGA	2	8	89657	89664	25 %	50 %	25 %	0 %	325291531
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1578	NC_015183	CAC	2	6	89733	89738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325291531
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1581	NC_015183	ACC	2	6	89839	89844	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325291531
1582	NC_015183	AGC	2	6	89885	89890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291531
1583	NC_015183	ATG	2	6	89918	89923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291531
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1585	NC_015183	TTG	2	6	89969	89974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325291531
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1587	NC_015183	TGA	2	6	90108	90113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291531
1588	NC_015183	GC	3	6	90122	90127	0 %	0 %	50 %	50 %	325291531
1589	NC_015183	CGG	2	6	90239	90244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291531
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1593	NC_015183	CTT	2	6	90330	90335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325291531
1594	NC_015183	GCT	2	6	90400	90405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291531
1595	NC_015183	ACG	2	6	90409	90414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291531
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1598	NC_015183	GCG	2	6	90467	90472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291531
1599	NC_015183	TGGCGC	2	12	90532	90543	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	325291531
1600	NC_015183	GGCT	2	8	90596	90603	0 %	25 %	50 %	25 %	325291531
1601	NC_015183	GCC	2	6	90617	90622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291531
1602	NC_015183	T	6	6	90657	90662	0 %	100 %	0 %	0 %	325291531
1603	NC_015183	GCG	2	6	90665	90670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291531
1604	NC_015183	GTT	2	6	90675	90680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325291531
1605	NC_015183	CTT	2	6	90681	90686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325291531
1606	NC_015183	GCG	2	6	90694	90699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291531
1607	NC_015183	GC	3	6	90713	90718	0 %	0 %	50 %	50 %	325291531
1608	NC_015183	CGG	3	9	90764	90772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291531
1609	NC_015183	CG	3	6	90813	90818	0 %	0 %	50 %	50 %	325291531
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1614	NC_015183	GTTG	2	8	90894	90901	0 %	50 %	50 %	0 %	325291531
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1621	NC_015183	GC	3	6	91355	91360	0 %	0 %	50 %	50 %	325291532
1622	NC_015183	GC	3	6	91392	91397	0 %	0 %	50 %	50 %	325291532
1623	NC_015183	ACGG	2	8	91582	91589	25 %	0 %	50 %	25 %	325291532
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1625	NC_015183	CGC	2	6	91608	91613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291532
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1873	NC_015183	ACG	2	6	103373	103378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291543
1874	NC_015183	GAT	2	6	103399	103404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291543
1875	NC_015183	TCTT	2	8	103457	103464	0 %	75 %	0 %	25 %	325291543
1876	NC_015183	GAT	2	6	103516	103521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291543
1877	NC_015183	GCA	2	6	103539	103544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291543
1878	NC_015183	GAT	2	6	103545	103550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291543
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1881	NC_015183	GCG	2	6	103948	103953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291544
1882	NC_015183	TGA	2	6	103978	103983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291544
1883	NC_015183	CG	3	6	104013	104018	0 %	0 %	50 %	50 %	325291544
1884	NC_015183	GC	4	8	104030	104037	0 %	0 %	50 %	50 %	325291544
1885	NC_015183	CAC	2	6	104073	104078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325291544
1886	NC_015183	TCG	2	6	104101	104106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291544
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1888	NC_015183	TGA	2	6	104213	104218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291544
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1892	NC_015183	ACG	2	6	104362	104367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291544
1893	NC_015183	TCGCG	2	10	104370	104379	0 %	20 %	40 %	40 %	325291544
1894	NC_015183	ATC	2	6	104413	104418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291544
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1899	NC_015183	TCG	2	6	104794	104799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291545
1900	NC_015183	AGCG	2	8	104804	104811	25 %	0 %	50 %	25 %	325291545
1901	NC_015183	GCG	3	9	104809	104817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291545
1902	NC_015183	TGC	2	6	104879	104884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291545
1903	NC_015183	AAG	2	6	104904	104909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325291545
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1905	NC_015183	GTG	3	9	104935	104943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325291545
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1907	NC_015183	GCA	2	6	105018	105023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291545
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1983	NC_015183	GCC	2	6	108962	108967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291548
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1988	NC_015183	CGCC	2	8	109096	109103	0 %	0 %	25 %	75 %	325291548
1989	NC_015183	CGTTTC	2	12	109181	109192	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	325291548
1990	NC_015183	TATT	2	8	109256	109263	25 %	75 %	0 %	0 %	325291549
1991	NC_015183	GGC	2	6	109265	109270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291549
1992	NC_015183	TGC	2	6	109320	109325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291549
1993	NC_015183	T	6	6	109344	109349	0 %	100 %	0 %	0 %	325291549
1994	NC_015183	ATC	2	6	109373	109378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291549
1995	NC_015183	CTC	3	9	109390	109398	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325291549
1996	NC_015183	CTC	3	9	109427	109435	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325291549
1997	NC_015183	GTCA	2	8	109442	109449	25 %	25 %	25 %	25 %	325291549
1998	NC_015183	TTCA	2	8	109781	109788	25 %	50 %	0 %	25 %	325291550
1999	NC_015183	GAC	2	6	109793	109798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291550
2000	NC_015183	CCG	2	6	109827	109832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291550

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